Sukcesywnie odbywa się dezynfekcja i płukanie sieci wodociągowej w celu zapewnienia bezpieczeństwa bakteriologicznego (mikrobiologicznego), Zakład Gospodarki Komunalnej w Kocmyrzowie-Luborzycy wykonuje profilaktyczną dezynfekcję wody na ujęciach oraz w zbiornikach wody pitnej.
Dodatkowo po awariach i wymknięciu wody na sieci dozowany jest, w niewielkich dawkach, podchloryn sodu. Stężenia stosowane do dezynfekcji są ściśle określone w przepisach dotyczących jakości wody przeznaczonej do spożycia (polskich, unijnych), przez co nie stanowią zagrożenia dla zdrowia.